Bioinformatic
Z serii ciekawe kursy o modelowaniu.
Następna strona www na której znajduje się wykład z MODELOWANIE MOLEKULARNE BIOCZĄSTECZEK I.

Wykład prowadzi Pani prof. dr hab. Marta Pasenkiewicz-Gierula z Uniwersytetu Jagiellońskiego.

Kurs zawiera informacje na tematy:

 

  • Definicja i perspektywy modelowania molekularnego
  • Struktura przestrzenna cząsteczki i oddziaływania międzyatomowe
  • Funkcja potencjału, parametry oddziaływań: a. wymiar problemu i stosowane przybliżenia, b. oddziaływania daleko-zasięgowe – stosowane modele
  • Metody obliczeniowe: a. mechanika molekularna (MM) – optymalizacja struktury, lokalna i globalna stabilność, b. symulacja dynamiki molekularnej (MD) – generowanie ruchu, c. krok czasowy – stosowane przybliżenia
  • Uzasadnienie podejścia klasycznego, ładunki atomowe
  • Kontrola parametrów termodynamicznych – temperatura i ciśnienie

Cały wykład można obejrzeć na stronie - http://bioinfo.mol.uj.edu.pl/courses/ModMol1. Serdecznie zapraszamy do lektury.