Z serii ciekawe kursy o modelowaniu. Następna strona www na której znajduje się wykład z MODELOWANIE MOLEKULARNE BIOCZĄSTECZEK I.
Wykład prowadzi Pani prof. dr hab. Marta Pasenkiewicz-Gierula z Uniwersytetu Jagiellońskiego.
Kurs zawiera informacje na tematy:
- Definicja i perspektywy modelowania molekularnego
- Struktura przestrzenna cząsteczki i oddziaływania międzyatomowe
- Funkcja potencjału, parametry oddziaływań: a. wymiar problemu i stosowane przybliżenia, b. oddziaływania daleko-zasięgowe – stosowane modele
- Metody obliczeniowe: a. mechanika molekularna (MM) – optymalizacja struktury, lokalna i globalna stabilność, b. symulacja dynamiki molekularnej (MD) – generowanie ruchu, c. krok czasowy – stosowane przybliżenia
- Uzasadnienie podejścia klasycznego, ładunki atomowe
- Kontrola parametrów termodynamicznych – temperatura i ciśnienie
Cały wykład można obejrzeć na stronie - http://bioinfo.mol.uj.edu.pl/courses/ModMol1. Serdecznie zapraszamy do lektury.