Aktualności
Obrót protonów grupy metylowej w projektowaniu nano-zabawek
Ćwiczenie
Obrót protonów grupy metylowej w projektowaniu nano-zabawek
Polarność rozpuszczalników
Ćwiczenie
Polarność rozpuszczalników
Nie jednokrotnie na zajęciach laboratoryjnych z chemii organicznej wykorzystywane są dwa typy rozpuszczalników polarne i nie polarne. Rozpuszczalniki stosowane to:
Tautomeryzacja poprzez wiązanie wodorowe w N-salicylidenoanilinie
Ćwiczenie
Tautomeryzacja poprzez wiązanie wodorowe w N-salicylidenoanilinie
Ciekawym przykładem reakcji jest tautomeryzacja N-salicylidenoaniliny, która wykazuje właściwości fotochromowe. W stanie podstawowym w ciemności substancja ta jest żółta, a po naświetleniu ultrafioletem (czyli po dostarczeniu energii do układu) przybiera barwę czerwoną. Zmiana barwy jest wyniku powstania formy tautomerycznej, która jest odpowiedzialna za fotochromizm.
Wiązania wodorowe a temperatura wrzenia
Ćwiczenie
Wiązania wodorowe a temperatura wrzenia
Temperatura wrzenia wody pod ciśnieniem 1013hPa wynosi 100°C, natomiast siarkowodoru -62.2. Na modelowym układzie ? dimer wody oraz dimer siarkowodoru oblicz energię dysocjacji dimerów, energie oddziaływania oraz błąd superpozycji bazy. Obliczenia przeprowadz metoda MP2/6-31G(d).
Energia obrotu grupy metylowej -CH3
Ćwiczenie
Energia obrotu grupy metylowej
Rotacja protonów w grupie metylowej -CH3 w pochodnych benzenu wymaga niewielkiej ilości energii. Energia ta zmierzona eksperymentalnie dla m-florotoluenu wynosi 4.39, dla o-florotoluenu 65.26, p-florotoluenu 13.82 oraz toluenu 13.94 kcal/mol.[1]
Geometria wiązań wodorowych
Ćwiczenie
Geometria wiązań wodorowych
Wiązania wodorowe (ang. hydrogen bond) możemy podzielić ze względu na liczbę geometrię oraz ilość oddziaływań, w których dany proton uczestniczy jako liniowe najprostsze, oraz osiowe (ang. bifurcate) jako bardziej złożone.
Komplementarność zasad purynowych
Ćwiczenie
Komplementarność zasad purynowych
Zasady azotowe: adenina (A), cytozyna (C), guanina (G), tymina (T) uracyl (U) w chodzącą w skład nukleozydów, które są połączeniem tych zasad z rybozą, deoksyrybozą lub rybitolem poprzez wiązanie N-glikozydowe. Estry nukleozydów z kwasem fosforowym (V) tworzą nukleotydy które są monomerami kwasów rybonukleinowych DNA i RNA. DNA jest nośnikiem informacji oraz występuje w chromosomach. Cząsteczka DNA przeważnie zbudowana jest z dwóch łańcuchów, które biegną antyrównolegle (tzn. koniec jednego łancucha jest na przeciw początku drugiego). Łańcuchy kwasu nukleinowego owijają się wokół wspólnej osi tworząc prawoskrętną podwójną helisę. Reszty fosforowe i cukrowe znajdują się na zewnątrz helisy i połączone ze sobą poprzez wiązanie fosfodiestrowe. Zasady skierowane są do wnętrza i tworzą pary zasad. Połączenie zasad jest poprzez wiązania wodorowe odpowiednio: A-T (A-U) G-C T-A (U-A) C-G.
Widmo podczerwieni i Ramana dla acetonu, tiomocznika i kwasu malonowego
. Przedstawiamy przykład obliczeń widm IR, Ramana dla acetonu, tiomocznika, i kwasu malonowego, oraz porównanie wyników teoretycznych z badaniami eksperymentalnymi. Autorką badań jest pani mgr inż. Karolina Gluza z Politechniki Wrocławskiej...
Gaussian - podstawowe informacje
To "klasyka" kwantowej chemii obliczeniowej, efekt pracy kilku pokoleń teoretyków, pierwotnie skupiających się wokół Johna Popla, który w 1998 roku otrzymał wspólnie z Walterem Kohnem nagrodę Nobla za wkład w metody obliczeniowe w chemii.
Programem tym można obliczyć wiele właściwości molekuł i reakcji, włączając w to:
- energie i strukturę cząsteczek,
- częstości drgań,
- widma IR, Ramana i UV-Vis,
- własności termochemiczne,
ArgusLab - Rafał Koczeń
ArgusLab jest programem bezpłatnym, oferuje on użytkownikowi możliwość tworzenia struktur chemicznych, umożliwia także wykonanie obliczeń optymalizacji geometrii i własności molekularnych z wykorzystaniem metod półempirycznych MNDO, AM1, PM3 i ZINDO...
Rysowanie wzorów chemicznych - MDL ISIS/Draw
Mamy zaszczyt przedstawić fragment kursu autorstwa dr Piotra Wojciechowskiego z Politechniki Wrocławskiej. Fragment kursu opisuje w jaki sposób rysować wzory chemiczne korzystając z programu MDL ISIS/Draw. Oryginalna strona kursu znajduje się www.eportal-ch.pwr.wroc.pl Jeszcze raz dziękujemy autorowi za udostępnienie materiałów.
Skrypt do Mechaniki Kwanowej - Stanisław Kryszewski
Z serii ciekawe opracowania. Pragniemy przedstawić kolejny skrypt z Mechaniki Kwantowej którego autorem jest profesor Stanisław Kryszewski z Uniwersytetu Gdańskiego. Skrypt ten, w zasadzie książka ponieważ liczy ponad 250 stron...
Skrypt do Bioinformatyki - dr Ewa Banachowicz
Mamy przyjemność przedstawić skrypt Dr Ewy Banachowicz z Zakładu Biofizyki Molekularnej Uniwersytetu Adama Mickiewicza w Poznaniu pod tytułem Bioinformatyka - Zagadnienia Bioinformatyczne dla studentów nanotechnologii, fizyki i biofizyki.
Skrypt do Chemii Kwantowej - dr Konrad Piszczatowski
Mamy zaszczyt zaprezentować następne miejsce, które może stać się doskonałą kopalnią wiedzy na temat Chemii kwantowej, czyli skrypt dr Konrada Piszczatowskiego z byłego doktoranta Pracowni Chemii Kwantowej Wydziału Chemii Uniwersytetu Warszawskiego
Lista super komputerów oraz klastrów komputerowych w Polsce -2008
Portal www.molnet.eu ma przyjemność przedstawić listę “super komputerów oraz klastrów komputerowych” będących do dyspozycji dla polskich grup badawczych. Polskie Centra komputerowe nie mają się czego wstydzić, część z komputerów prezentowanych np.: nautilius, nova, galera, zeus, etc. są (bądź były) na liście TOP 500 superkomputerów....
Strona 3 z 4