Początkami serwisu były materiały opublikowane w skrypcie do Modelowanie molekularne w chemii organicznej[1]. Następnie materiały te zostały rozbudowane, poprawione, dodane nowe działy w taki sposób że serwis zaczął żyć własną oryginalną formą. Część nowych materiałów wciąż jest podczas procesu redakcji. Staramy się żeby każdego tygodnia zostały dodane nowe dodatkowe materiały. Forma skryptu na którym bazował jest już nieaktualna, i najbardziej aktualną wiedzą z zakresu Praktycznego Modelowania Molekularnego jest prezentacja w postaci serwisu www.molnet.eu. Dążymy do tego, aby portal ten był praktycznym wykorzystaniem wiedzy z modelowania do rozwiązywania problemów, przewidywania badań.  "Molnetowskie" treści dotyczące Modelowania Molekularnego znajdujące się poza działami to:

  • Wstęp do modelowania
  • Zapis cząsteczki w postaci Z-macierzy i w układzie kartezjańskim
  • Przesyłanie plików do Centrów Komputerowych
  • Energia - Geometria - Optymalizacja
  • Przeliczanie energii
  • Molekularny elektrostatyczny potencjał (w recenzji)
  • Modelowanie mechanizmów reakcji chemicznych (w ostatniej fazie przygotowania)
  • Energia oddziaływania (w recenzji)
  • Błąd w Superpozycji Bazy BSSE (w recenzji)

Dodatkowe materiały znajdują się w działach:

  • Ćwiczenia
  • Programy: Gaussian, GaussView, Hyperchem
  • Molekularna biblioteka
  • Galeria