Gaussian
Gaussian - Zagadnienia, opisy, instrukcje oraz praktyczne wykorzystanie programu Gaussian - www.gaussian.com. Materiały mają na celu edukacje i są dostępne bezpłatnie. Osoby zainteresowane kupnem oprogramowania Gaussian, Gaussview proszone są o kontakt z przedstawicielem (http://www.gaussian.com/)
Obliczenia powierzchni energii potencjalnej (PES) możemy przygotować korzystając z programu graficznego GaussView.
W tym celu po skonstruowaniu cząsteczki definiujemy zmieniający się parametr wybierając z menu Edit opcję Redundant Coord editor, lub ikonę 
z menu. Po wybraniu tej opcji pojawia się nowe okno, z którego klikamy lewą górna ikonę 
.
Czytaj więcej: Obliczenia powierzchni energii potencjalnej (PES)
Opis praktyczny zagadnienia "Energia - Geometria - Optymalizacja" - Przygotowanie obliczeń w programie Gaussian
Posługując się programem GaussView, w pierwszym etapie konstruujemy cząsteczkę. Następnie wybieramy z menu Calculate opcję Gaussian Ctrl+G. W oknie, które się pojawi:
Czytaj więcej: Gaussian - Energia - Geometria - Optymalizacja
2.1.6 Przenoszenie obliczeń między różnymi systemami
Podczas wykonywania obliczeń czasami konieczne jest przeniesienie obliczenia na inną maszynę, system. Wówczas musimy przenieść plik binarny- checkpoint (.chk), który zależy od zainstalowanej wersji Gaussiana.1 Robimy to poprzez wygenerowanie checkpointu w postaci tekstowej - ASCII.2 Uzyskany formatowany checkpoint posiada rozszerzenie .fchk - (Gaussian Formatted Checkpoint Files) i może być wykorzystywany, oprócz przenoszenia obliczeń przez niektóre programy na przykład do wizualizacji wyników. Formatowany checkpoint otrzymujemy poprzez polecenie formchk:
formchk nazwa.chk nazwa.fchk
Czytaj więcej: Gaussian - przenoszenie obliczeń na różne maszyny
Dokonując obliczeń w kilku etapach (np.: optymalizując cząsteczkę, a następnie obliczanie wartości parametrów NMR), możemy nasze obliczenia wykonać, przygotowując tylko jeden plik wsadowy: Plik nasz musi zawierać linie ze zwrotem --Link1-- po którym umieszczone są kolejne zadania do obliczeń, np.: