Poniżej znajdują się wszystkie zagadnienia z modelowania molekularnego obejmujące problemy chemii obliczeniowej, spektroskopii, katalizy. Informacje nie są usystematyzowane, możesz przeszukać je, przeglądając artykuły. Materiały te powstały podczas Praktycznych szkół Modelowania Molekularnego i są oferowane nie odpłatnie. Jeżeli chcesz, dostępne są dwie książki do pobrania w naszym innym serwisie rozwijanym z pasji do popularyzacji wiedzy i chęci przekazania tej pasji dzieciom.
Zaawansowane obliczenia wymagają stabilnych i wydajnych systemów operacyjnych, dlatego prawie wszystkie Centra Komputerowe mają zainstalowane systemy operacyjne z rodziny Unix oraz Linux. Zainstalowane tam oprogramowanie do modelowania jest dla odpowiedniej wersji systemowej. Pierwszym krokiem korzystania z komputerów w Centrum Obliczeniowym np.: WCSS, PCSS, CI TASK jest skopiowanie odpowiednich plików na maszynę.
Kopiowanie plików w systemie Linux, Unix
Posiadając jeden z systemów operacyjnych z rodziny Linux bądź Unix na swoim komputerze możemy skopiować plik korzystając z polecenie scp
Czytaj więcej: Przesyłanie plików do Centrów Komputerowych -2010
ArgusLab jest programem bezpłatnym, oferuje on użytkownikowi możliwość tworzenia struktur chemicznych, umożliwia także wykonanie obliczeń optymalizacji geometrii i własności molekularnych z wykorzystaniem metod półempirycznych MNDO, AM1, PM3 i ZINDO...
Mamy zaszczyt przedstawić fragment kursu autorstwa dr Piotra Wojciechowskiego z Politechniki Wrocławskiej. Fragment kursu opisuje w jaki sposób rysować wzory chemiczne korzystając z programu MDL ISIS/Draw. Oryginalna strona kursu znajduje się www.eportal-ch.pwr.wroc.pl Jeszcze raz dziękujemy autorowi za udostępnienie materiałów.
Podczas przebudowania strony zdecydowaliśmy wyłączyć opcje druku 3D.molnet.eu. było nam niezmiernie miło, służąc od 2013 roku nauce oraz ludziom w tworzeniu fizycznych wizualizacji - cząsteczek, układów 3d, powierzchni - czy prototypownia różnych urządzeń. Dziś każde nowoczesne laboratorium ma dostęp do drukarek 3D - dlatego nie ma sensu prowadzić wciąż serwis druku 3d specjalizujący się w cząsteczkach. Możemy być dumni, że w Polsce byliśmy pierwsi, którzy prowadzili taką usługę !!
2013-2024.
Oto nasze niektóe realizacje
Opis - Przykłady hydratacji jonu magnezu przez 6 cząsteczek wody
Metoda optymalizacji - B3LYP/6-31G(d,p) PCM H2O
Cytowanie - M. Doskocz, K. Kubas, A. Frackowiak, R. Gancarz, NMR and ab initio studies of the effect of Mg2+, Ca2+, Zn2+, Cu2+ complexation by alizarin, Polyhedron doi:10.1016/j.poly.2009.01.046
- Fulleren
- Nanorurka
- Alkohole- Właściwości biologiczne oraz toksyczne -etanol. metanol
- Warsztaty NANO
- Projektowanie leków - qsar
- Modelowanie molekularne biocząsteczek I
- Modelowanie molekularne biocząsteczek II
- Mały wykład z mechaniki kwantowej
- Skrypt do Mechaniki Kwanowej - Stanisław Kryszewski
- Skrypt do Bioinformatyki - dr Ewa Banachowicz
- Skrypt do Chemii Kwantowej - dr Konrad Piszczatowski
- Lista super komputerów oraz klastrów komputerowych w Polsce -2008
- Centra obliczeniowe w Polsce
- Analiza NBO
- Spektroskopia w podczerwieni IR cz. 1 - lektor